近日，中国农业科学院郑州果树研究所西瓜遗传育种与栽培创新团队对西瓜种子大小自然变异的分子基础进行系统研究，揭示了西瓜种子大小遗传变异基础。相关研究成果发表在《园艺研究（Horticulture Research）》上。

种子大小是西瓜重要的农艺性状之一，不同种质资源种子差异很大，籽用西瓜种子显著大于鲜食西瓜种子，因此基于市场需求选育不同种子大小的西瓜品种具有现实意义。

该团队对代表西瓜种子大小的五个参数（百粒重，种长，种宽，种厚，种脐长度）进行了表型测定与全基因组关联分析。发现粘籽西瓜与籽瓜的种子显著大于其他类型的西瓜，种子扩张可能是西瓜遗传驯化过程中的重要特征之一。西瓜种子大小主要是由种长、种宽和百粒重决定的，全基因组关联分析获得与种子百粒重、长、宽显著相关的SNP位点和候选基因，并进一步对候选基因的功能进行了初步探究。研究成果为西瓜育种提供了丰富的数据支撑，并为分子标记辅助育种提供了潜在的分子标记。

该研究得到国家自然科学基金、国家重点研发计划、国家现代农业产业技术体系、中国农科院科技创新工程等项目资助。