水稻多器官单细胞多组学图谱问世

来源: 光明日报 2025-07-18 09:05:56

记者从中国农业科学院生物技术研究所获悉,该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构,构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱,系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用,有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。

单细胞组学是近年来生命科学领域的一项重要技术突破,对揭示细胞间的不同之处,从更精细水平研究细胞功能具有独特优势。中国农业科学院生物技术研究所研究员谷晓峰介绍,水稻是我国最重要的粮食作物之一,其根、茎、叶、种子等器官由多种功能细胞组成,这些细胞类型对水稻发育、产量与抗性都具有重要作用,但目前对其系统鉴定及功能解析的进展仍然有限。因此,利用单细胞等新兴技术,从细胞层面系统刻画水稻不同器官的细胞类型与状态,解析其分子调控机制,可以为解析水稻发育和重要农艺性状的形成提供新路径。

本次研究针对水稻8个器官中超过11万个细胞开展研究,对其中的基因进行同步测序和深度分析,最终,通过原位杂交实验验证了54种细胞类型,并构建了细胞类型特异的基因调控网络。

研究团队首次发现,水稻的花序分生组织中存在“过渡态”细胞,并揭示了其在细胞命运转变中的关键作用。团队还识别并验证了多个关键调控基因在特定细胞类型中的功能,如RSR1基因能够调控根皮层细胞发育,F3H基因能够协调碳氮代谢等。研究还整合全基因组关联分析数据,发现水稻株高、粒型、结实率等农艺性状与特定细胞类型之间存在对应关系,并揭示细胞功能在进化过程中的保守性与多样性。

本次研究还正式发布水稻单细胞多组学数据库Rice-SCMR,为功能基因挖掘与智能育种提供了基础平台。这些研究成果为水稻单细胞水平智能设计育种提供了数据、基因和技术基础,为作物改良开辟了新路。(记者 杨舒)

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